Neben Mikroskopen und Petrischalen sind Computer ein wichtiges Werkzeug für Mikrobiologen. Software für die mikrobiologische Forschung umfasst Werkzeuge, die von anderen wissenschaftlichen und technischen Disziplinen verwendet werden, sowie spezielle Anwendungen für die Untersuchung von Bakterien und anderen Mikroorganismen. Viele Anwendungen, die von Regierungsbehörden, gemeinnützigen Stiftungen oder akademischen Forschern entwickelt wurden, stehen als kostenlose Software zum Herunterladen und Verwenden zur Verfügung, wenn Ihr Experiment oder Ihr Labor es erfordert.
Visualisierungstools
Ein physisches oder mentales Bild der von Ihnen gesammelten Rohdaten kann Ihnen helfen, deren Qualität, Bedeutung und Auswirkungen besser zu erfassen. Open-Source- und kommerzielle Datenvisualisierungssoftware ist für die mikrobiologische Forschung weit verbreitet. Erstellen Sie Diagramme und Grafiken Ihrer Daten mit LibreOffice Calc, Microsofts Excel oder dem Mondrian-Datenvisualisierungssystem. Cell-O- und RasMol-Anwendungen helfen Ihnen bei der Erstellung von 2D- und 3D-animierten Modellen von biologisch bedeutsamen Molekülen wie Proteinen und Aminosäuren.
Mathematische Modellierung
Große Sammlungen mikrobiologischer Daten liefern oft aussagekräftigere Informationen, wenn sie numerisch analysiert wurden. MATLAB-, Octave- und SciPy-Softwarepakete zur mathematischen Verfeinerung, Analyse und Modellierung von Wissenschaftlerdaten. Verwenden Sie diese Pakete, um Parameterschätzungen durch Kurvenanpassung, epidemiologische Vorhersagen, Bakterienwachstumssimulationen und Datenrauschen oder Eliminierung stochastischer Effekte durchzuführen. Diese Anwendung führt auch statistische Berechnungen wie Varianzanalysen oder Chi-Quadrat-Tests durch.
Genombioinformatik
Mikrobiologie-Softwareanwendungen helfen Ihnen auch, Informationen aus der Sequenz von Nukleinsäuren, aus denen die DNA eines Mikroorganismus besteht, zu visualisieren und zu ermitteln. Die Open Bioinformatics Foundation bietet kostenlose Open-Source-DNA-Sequenzierungs- und -Analyseanwendungen wie BioJava und Biopython, die Daten aus Genominformationsbanken extrahieren, den DNA-Code eines Organismus analysieren und mit anderen DNA-Proben vergleichen. Zusätzliche Genomanalysepakete umfassen Emboss, HMMER, Clustal Omega, Phylogeny Inference Package oder PHYLIP und die Sequence Manipulation Suite oder SMS.
Referenzsoftware
Das rasante Tempo wissenschaftlicher Entdeckungen in der Mikrobiologie und sich ändernde staatliche Vorschriften machen es unerlässlich, dass Mikrobiologen leichten Zugang zu Informationen haben, die ihre Arbeit beeinflussen. HUGO ist ein kommerzielles Softwarepaket, das Mikrobiologen aktuelle Informationen zu Werkzeugen, Chemikalien, Ausrüstung, Nährmedien, Sicherheitsanforderungen, neuen Organismen, taxonomischen Veränderungen und Antibiotika liefert. Darüber hinaus können in der Lebensmittelwissenschaft tätige Mikrobiologen mit der Webanwendung ComBase Browser auf die lebensmittelbezogenen mikrobiologischen Daten zugreifen, die von Regierungsbehörden in Großbritannien, Australien und den USA bereitgestellt werden.
